Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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D130052B06RikQ3UW13 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
D130052B06RikQ3UW13 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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