Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod2Q3UHZ5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms