Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms