Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem35bQ3U0Y2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms