Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms