Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ccdc136Q3TVA9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms