Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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