Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms