Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms