Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl9Q32KG4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl9Q32KG4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl9Q32KG4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl9Q32KG4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl9Q32KG4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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