Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms