Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptcd3Q14C51 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms