Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col19a1Q0VF58 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms