Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms