Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MestQ07646 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MestQ07646 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms