Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col17a1Q07563 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col17a1Q07563 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms