Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms