Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

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Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sox13Q04891 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sox13Q04891 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sox13Q04891 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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