Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox12Q04890 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms