Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox9Q04887 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms