Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox8Q04886 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox8Q04886 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms