Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CkbQ04447 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CkbQ04447 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms