Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnd1Q03719 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms