Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnb1Q03717 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms