Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdcd1Q02242 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms