Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms