Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms