Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms