Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2bQ01097 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms