Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde1bQ01065 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms