Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GabpaQ00422 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms