Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms