Protein–RNA interactions for Protein: P97861

Krt86, Keratin, type II cuticular Hb6, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt86P97861 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt86P97861 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms