Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cited1P97769 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited1P97769 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms