Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pitx2P97474 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms