Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms