Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms