Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rps3aP97351 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms