Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms