Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SgcdP82347 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SgcdP82347 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SgcdP82347 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SgcdP82347 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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