Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nucb2P81117 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms