Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms