Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc8a1P70414 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc8a1P70414 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms