Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms