Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SeboxP70368 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms