Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms