Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SbdsP70122 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SbdsP70122 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms