Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms