Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms