Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vamp3P63024 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms